MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015942	GGC	2	6	22867	22872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198262
502	NC_015942	CGC	3	9	22952	22960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198262
503	NC_015942	AT	3	6	23005	23010	50 %	50 %	0 %	0 %	344198262
504	NC_015942	TGG	2	6	23047	23052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198262
505	NC_015942	GAT	2	6	23154	23159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198262
506	NC_015942	TGA	2	6	23189	23194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198262
507	NC_015942	CGC	2	6	23210	23215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198262
508	NC_015942	CAGCG	2	10	23217	23226	20 %	0 %	40 %	40 %	344198262
509	NC_015942	GGCGC	2	10	23243	23252	0 %	0 %	60 %	40 %	344198262
510	NC_015942	CCG	2	6	23296	23301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198262
511	NC_015942	GCG	2	6	23309	23314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198262
512	NC_015942	TAT	2	6	23372	23377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198262
513	NC_015942	TGG	2	6	23404	23409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198262
514	NC_015942	C	7	7	23550	23556	0 %	0 %	0 %	100 %	344198262
515	NC_015942	GCGG	2	8	23558	23565	0 %	0 %	75 %	25 %	344198262
516	NC_015942	AAT	2	6	23592	23597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198262
517	NC_015942	GAG	2	6	23832	23837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198262
518	NC_015942	TTG	2	6	23851	23856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198262
519	NC_015942	AGG	2	6	23927	23932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015942	TGG	3	9	23962	23970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198263
521	NC_015942	GGA	2	6	24011	24016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198263
522	NC_015942	GCC	2	6	24054	24059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198263
523	NC_015942	TGG	2	6	24082	24087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198263
524	NC_015942	TCC	2	6	24094	24099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198263
525	NC_015942	CCT	2	6	24134	24139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198263
526	NC_015942	AGC	2	6	24166	24171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198263
527	NC_015942	GGT	2	6	24173	24178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198263
528	NC_015942	GAT	2	6	24179	24184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198263
529	NC_015942	CGG	2	6	24208	24213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198263
530	NC_015942	GC	3	6	24335	24340	0 %	0 %	50 %	50 %	344198263
531	NC_015942	GGCT	2	8	24344	24351	0 %	25 %	50 %	25 %	344198263
532	NC_015942	GCG	2	6	24367	24372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198263
533	NC_015942	TGC	2	6	24439	24444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198263
534	NC_015942	CG	3	6	24476	24481	0 %	0 %	50 %	50 %	344198263
535	NC_015942	GCC	3	9	24534	24542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198263
536	NC_015942	TCGC	2	8	24544	24551	0 %	25 %	25 %	50 %	344198263
537	NC_015942	GCG	2	6	24704	24709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198263
538	NC_015942	GGGT	2	8	24718	24725	0 %	25 %	75 %	0 %	344198263
539	NC_015942	GAC	2	6	24728	24733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198263
540	NC_015942	GCCCGT	2	12	24734	24745	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344198263
541	NC_015942	CTA	2	6	24821	24826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198263
542	NC_015942	TGCCC	2	10	24836	24845	0 %	20 %	20 %	60 %	344198263
543	NC_015942	GCC	2	6	24854	24859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198263
544	NC_015942	CG	3	6	24866	24871	0 %	0 %	50 %	50 %	344198263
545	NC_015942	AGA	2	6	24896	24901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198263
546	NC_015942	GGC	2	6	24935	24940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198263
547	NC_015942	GC	3	6	24939	24944	0 %	0 %	50 %	50 %	344198263
548	NC_015942	TGC	2	6	24970	24975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198263
549	NC_015942	TGG	2	6	25018	25023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198263
550	NC_015942	GC	3	6	25078	25083	0 %	0 %	50 %	50 %	344198263
551	NC_015942	GC	3	6	25154	25159	0 %	0 %	50 %	50 %	344198263
552	NC_015942	ATC	2	6	25192	25197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198263
553	NC_015942	CG	3	6	25220	25225	0 %	0 %	50 %	50 %	344198263
554	NC_015942	GTG	2	6	25236	25241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198263
555	NC_015942	GCAC	2	8	25252	25259	25 %	0 %	25 %	50 %	344198263
556	NC_015942	GAA	2	6	25274	25279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198263
557	NC_015942	GAG	2	6	25329	25334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198263
558	NC_015942	ACA	2	6	25378	25383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_015942	ATT	2	6	25557	25562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198264
560	NC_015942	TGT	2	6	25597	25602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198264
561	NC_015942	GTGCC	2	10	25752	25761	0 %	20 %	40 %	40 %	344198264
562	NC_015942	TA	3	6	25853	25858	50 %	50 %	0 %	0 %	344198264
563	NC_015942	T	6	6	25864	25869	0 %	100 %	0 %	0 %	344198264
564	NC_015942	A	6	6	25910	25915	100 %	0 %	0 %	0 %	344198264
565	NC_015942	CCAG	2	8	25918	25925	25 %	0 %	25 %	50 %	344198264
566	NC_015942	AGA	2	6	26005	26010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198264
567	NC_015942	TAA	2	6	26032	26037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198264
568	NC_015942	GCA	2	6	26074	26079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198264
569	NC_015942	CTG	2	6	26094	26099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198264
570	NC_015942	TGG	2	6	26244	26249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198264
571	NC_015942	TTG	2	6	26295	26300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198264
572	NC_015942	TGG	2	6	26329	26334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198264
573	NC_015942	CGT	2	6	26474	26479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198264
574	NC_015942	TA	3	6	26592	26597	50 %	50 %	0 %	0 %	344198264
575	NC_015942	CTT	2	6	26644	26649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198264
576	NC_015942	ATT	2	6	26682	26687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198264
577	NC_015942	TAA	2	6	26701	26706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198264
578	NC_015942	GCA	2	6	26713	26718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198264
579	NC_015942	TAC	2	6	26789	26794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198264
580	NC_015942	CTT	2	6	26895	26900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_015942	TGT	2	6	26914	26919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015942	GCC	2	6	26936	26941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_015942	TTG	2	6	26958	26963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015942	ATG	2	6	27025	27030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015942	GGCTT	2	10	27080	27089	0 %	40 %	40 %	20 %	344198265
586	NC_015942	T	6	6	27111	27116	0 %	100 %	0 %	0 %	344198265
587	NC_015942	TGG	2	6	27139	27144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198265
588	NC_015942	GTGC	2	8	27172	27179	0 %	25 %	50 %	25 %	344198265
589	NC_015942	AAAAT	2	10	27245	27254	80 %	20 %	0 %	0 %	344198265
590	NC_015942	CCA	2	6	27274	27279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198265
591	NC_015942	CAT	2	6	27324	27329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198265
592	NC_015942	TTC	2	6	27383	27388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198265
593	NC_015942	AGC	2	6	27495	27500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198265
594	NC_015942	ATT	2	6	27506	27511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198265
595	NC_015942	AAT	2	6	27514	27519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198265
596	NC_015942	TGC	2	6	27524	27529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198265
597	NC_015942	AAC	2	6	27536	27541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198265
598	NC_015942	AAAC	2	8	27551	27558	75 %	0 %	0 %	25 %	344198265
599	NC_015942	A	6	6	27600	27605	100 %	0 %	0 %	0 %	344198265
600	NC_015942	TGA	2	6	27641	27646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198265
601	NC_015942	TGG	2	6	27691	27696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198265
602	NC_015942	GAT	2	6	27810	27815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198265
603	NC_015942	CTA	2	6	27827	27832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198265
604	NC_015942	TGG	2	6	27833	27838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198265
605	NC_015942	ATT	2	6	27853	27858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198265
606	NC_015942	CGC	2	6	27873	27878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198265
607	NC_015942	TGA	2	6	27879	27884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198265
608	NC_015942	CCAAAG	2	12	27944	27955	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	344198265
609	NC_015942	GCA	2	6	27979	27984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198265
610	NC_015942	CTA	2	6	28001	28006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198265
611	NC_015942	GGA	2	6	28026	28031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198265
612	NC_015942	GC	4	8	28172	28179	0 %	0 %	50 %	50 %	344198265
613	NC_015942	CAAA	2	8	28214	28221	75 %	0 %	0 %	25 %	344198265
614	NC_015942	TGT	2	6	28290	28295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198265
615	NC_015942	CAGG	2	8	28437	28444	25 %	0 %	50 %	25 %	344198265
616	NC_015942	AT	3	6	28577	28582	50 %	50 %	0 %	0 %	344198265
617	NC_015942	GCGA	2	8	28609	28616	25 %	0 %	50 %	25 %	344198265
618	NC_015942	GC	3	6	28621	28626	0 %	0 %	50 %	50 %	344198265
619	NC_015942	TTG	2	6	28660	28665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198265
620	NC_015942	ATCC	2	8	28707	28714	25 %	25 %	0 %	50 %	344198266
621	NC_015942	C	6	6	28780	28785	0 %	0 %	0 %	100 %	344198266
622	NC_015942	GTC	2	6	28798	28803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198266
623	NC_015942	TCCTG	2	10	28824	28833	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
624	NC_015942	TCC	2	6	28905	28910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_015942	TGA	2	6	28917	28922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015942	ATTT	2	8	28940	28947	25 %	75 %	0 %	0 %	344198267
627	NC_015942	GACATC	2	12	28958	28969	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344198267
628	NC_015942	CGG	2	6	28977	28982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198267
629	NC_015942	CGGTAG	2	12	29097	29108	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344198267
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989	NC_015942	CTCC	2	8	45951	45958	0 %	25 %	0 %	75 %	344198275
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996	NC_015942	ACCGC	2	10	46213	46222	20 %	0 %	20 %	60 %	344198275
997	NC_015942	GCC	2	6	46234	46239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198275
998	NC_015942	CTACCC	2	12	46313	46324	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	344198275
999	NC_015942	GGC	2	6	46352	46357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198275
1000	NC_015942	GCA	2	6	46391	46396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198275

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